24 ноября 2012 года, в рамках Дней Якутской епархии, в церковно-археологическом кабинете академии открылась международная научно-практическая конференция «Миссия Русской Православной Церкви в Сибири и Америке», посвященная 215-летию со дня рождения святителя Иннокентия (Вениаминова). Конференция проходила под председательством ректора МДА архиепископа Верейского Евгения и епископа Якутского и Ленского Романа.

В ходе конференции прозвучали доклады представителей Московской духовной академии, Якутской епархии, Корейской митрополии, Оксфордского университета, Православного института в Париже, Московских университетов.

От академии в конференции приняли участие — преподаватель МДА Г. Е. Колыванов с докладом «Богословские воззрения святителя Иннокентия (Вениаминова)» и студент МДА Дмитрий Попов с докладом «Участник Аляскинской миссии, благочинный Актюбинского округа митрофорный протоиерей Сергий Михайлович Попов». В ходе конференции состоялась презентация трех томов юбилейного собрания сочинений святителя Иннокентия (Вениаминова) – апостола Америки, просветителя северных народов. Собрание сочинений – это новый этап в истории издания трудов и писем святителя, которое будет издано в 7 томах. Новое издание – это совместный проект Якутской и Ленской епархии и Издательства Московской Патриархии Русской Православной Церкви.